Die Sumpf-Kreuzblume kommt in den Kalkgebieten Baden-Württembergs zum Teil verbreitet vor, besonders auf der Schwäbischen Alb, den Randplatten des Schwarzwaldes, im Oberrheingebiet, Bauland, Bodebseegebiet und dem Westallgäuer Hügelland. Ansonsten ist die Art seltener oder fehlt streckenweise ganz.
In meiner Umgebung im südlichen Oberschwaben habe ich sie noch nicht oft gesehen.